El sistema del Iberá es un importante reservorio de especies amenazadas de extinción.
El ciervo de los pantanos posee allí la mayor población en el país; el venado de las pampas, el aguará guazú, el tordo amarillo o el pato crestudo se conservan junto a centenares de especies de plantas y peces.
Los vertebrados mayores suman unas 500 especies, son el 25% del total del país.
Dentro de los esteros se encuentra el “Sitio Ramsar. Lagunas y Esteros del Iberá”, designado con este nombre en 2002, que ocupa una superficie de 24550 hectáreas.
La laguna de Iberá es el principal espejo de agua del sitio Ramsar que se protege bajo la categoría de “humedal de importancia internacional”.
